监国潞王朱常汸，再次巡谒孝陵，又祭告太庙，还提前从杭州再次请来了懿安皇后作为先帝遗命的转述人见证整个流程，连带着坤兴公主也参加了典礼。
做足了工夫后，朱常汸在史可法的领班宣读下，正式登基，因为没有跨年，暂时还不用改元，依然是崇祯十七年的年号。但是已经拟定，等来年元旦，就要改元“隆武”，以彰显武功，恢复中原。
兵部尚书史可法为武英殿大学士，担任内阁首辅，户部尚书沉廷扬为文华殿大学士，担任内阁次辅。
为了笼络人心，朱常汸还给他们都封了伯爵。武将当中，此前在拥立监国、以及后来遏制福王的过程中有主要功劳的将领，也有两个捞到了伯爵，分别是黄得功和张名振。
黄得功是朱树人派去提防福王从凤阳入侵信阳、扩大地盘的。张名振则是运气好，当初堵住了刘良左渡江。但他们的功劳毕竟要低一级，这些伯爵都是不能世袭的，只有他们本人可以终身担任一代。以后再有功劳，可以酌情再加赏。
其他平叛有功的将领，不够突出卓着的，凡是原本就有总兵官级别，如今也都给个将军号，提高荣誉待遇。
另外，朱树人在这次平定两广、回事途中顺便还把两广和江西交界的赣南山区流贼残部打击了一下，整个过程中，朱树人也给了一些此前崇祯时期被戴罪立功禁锢的降将以表现机会。
比如，一直坚持到张献忠死前才投降的李定国，因为这一世是在崇祯末年被解决的，所以哪怕戴罪立功，此前也不好给官职。
朱树人为了用好李定国、孙可望等人，也是煞费苦心，这次就带着他们一起，去平叛靖江王的途中刷功劳。朱树人还不好用流贼旧部去直接打叛乱藩王，怕被人指责“以疏间亲”，所以就只能让李定国在赣南山贼身上刷刷。
好在此前残留在赣南的山贼，基本上也是崇祯十五年时、张献忠在衡州决战中被朱树人打崩后，往西逃散的那部分偏师。
所以李定国孙可望奉命去剿辅并用，也算是非常顺利，当地头目听说朝廷可以既往不咎，只要处理几个截杀守法藩王的典型，其他人都能投军，还足饷确保不被克扣，也就大部分归降了。极少数死硬分子，也成了李定国刷功劳的人头数。
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